Система керування агрегатом повітряного опалення з електричним нагрівачем (АVN-Е) передбачає ввімкнення/вимкнення агрегату, захист вентилятора від перегріву за допомогою вбудованих теплових контактів і короткого замикання за допомогою запобіжника, двоступеневий захист нагрівача від перегріву. Захист електронагрівача від перегріву здійснюється за допомогою двох біметалевих термостатів на корпусі нагрівача. Якщо вимкнення нагрівача було викликано спрацьовуванням термореле з автоматичним поверненням (60° С), то після охолодження ТЕНів живлення нагрівача відновиться. Якщо причиною вимкнення нагрівача було спрацьовування термореле з ручним поверненням (90° С), то потрібне втручання чергового персоналу. Система керування має світлову індикацію роботи вентилятора та аварійних станів агрегату. Опціонально можливе підключення регуляторів температури (термостат кімнатний) і регулятора обертів електродвигуна вентилятора.
При застосуванні кімнатного термостата підтримання температури повітря в приміщенні проводиться шляхом дискретного ввімкнення і вимкнення АVN-Е за кімнатним термостатом. При цьому в кожній системі керування АVN-Е передбачений керуючий беспотенціальний вихід, який може бути використаний як дублюючий термостат. Таким чином, за допомогою всього лише одного термостата можна регулювати потужність відразу декількох агрегатів повітряного опалення. У системі керування передбачено підключення нормально замкнутих контактів пожежної сигналізації (живлення ланцюга 220 В).